Na prelome tisícročí bola najväčšou hviezdou svetovej atletiky. Bývalá americká šprintérka bola ústrednou postavou olympijských hier v Sydney 2000, na ktorých získala tri zlaté a dve bronzové medaily.
Jonesová získala zlato v šprintoch na 100 aj 200 metrov, v štafete na 4 × 100 m, bronz pridala v skoku do diaľky a štafete na 4 × 400 m. No kvôli dopingu o všetky cenné kovy o niekoľko rokov prišla.
Američanka bola zapletená do jedného z najväčších dopingových škandálov v histórii športu. Jej prípad, spojený s laboratóriom BALCO, odhalil rozsiahlu sieť užívania zakázaných látok medzi elitnými atlétmi. K odhaleniu prišlo v roku 2003 po razii FBI v laboratóriu v Kalifornii.
BALCO dodávalo zakázané látky, napríklad steroidy THG – tetrahydrogestrinon a The Clear. Škandál ovplyvnil vyše 20 top atlétov, vrátane jej bývalého manžela C.J. Huntera (vrhača guľou) a priateľa Tima Montgomeryho.
5. októbra 2007 Jonesová v liste rodine a priateľom priznala užívanie steroidov pred OH 2000. Na súde v New Yorku sa priznala k dvom zločinom: klamanie federálnym vyšetrovateľom o dopingu a zapojenie sa do podvodu s falošnými šekmi (následne vrátila 500 000 dolárov.
V januári 2008 bola odsúdená na 6 mesiacov väzenia (trest si odpykala v Texase), 2 roky podmienečne a 800 hodín verejnoprospešných prác. Zaplatila aj pokutu 10 000 dolárov. Medzinárodný olympijský výbor jej v decembri 2007 odobral jej 5 medailí z OH 2000. Prišla aj o rekordy a tituly z majstrovstiev sveta v rokoch 1999 a 2001.
Kedysi najrýchlejšia žena planéty, dnes 50-ročná dôchodkyňa, zverejnila na Instagrame dojímavé video. Na ňom je Jonesovú vidieť, ako s viditeľnou námahou schádza dolu schodmi a drží sa zábradlia.
V posledných rokoch Jonesová bojuje s Devicovou chorobou, známou aj ako neuromyelitis optica (NMO). Ide o zriedkavé autoimunitné ochorenie, ktoré postihuje hlavne zrakové nervy a miechu.
Vlastný imunitný systém pacienta napáda ochranný obal nervov (myelín) v týchto oblastiach, čo vedie k demyelinizácii. Medzi príznaky patria strata zraku, slabosť alebo ochrnutie končatín, problémy s močovým mechúrom a črevami, bolesť a kŕče. Ochorenie sa často zamieňa s roztrúsenou sklerózou, ale liečba je odlišná.